玉米HSP20基因家族的分子进化和表达分析任务书

 2022-11-15 10:03:57

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

1. 掌握植物基因家族成员的鉴定、染色体分布和复制事件、系统发育、基因结构和保守基序、基因表达分析等方法。

2. 鉴定出玉米基因组中的HSP20基因,明确其进化历史与机制、基因表达模式、蛋白质互作情况等。

2. 实验内容和要求

1.玉米中HSP20基因的系统鉴定。通过关键词搜索、BLAST比对等手段鉴定出玉米中HSP20家族所有成员;

2. 基因复制和系统发育分析。通过分析HSP20基因的复制事件和系统发育关系,明确该家族的进化历史与机制;

3. 基因表达分析。通过检索NCBI EST数据库获得基因表达信息,明确玉米HSP20基因在不同组织器官中的表达情况。

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3. 参考文献

[1] Ouyang Y, Chen J, Xie W, et al. Comprehensive sequence and expression profile analysis of Hsp20 gene family in rice[J]. Plant Mol.Biol., 2009,70(3):341-357.

[2] 张宁, 姜晶, 史洁玮. 番茄HSP20基因家族的全基因组鉴定、系统进化及表达分析[J]. 沈阳农业大学学报, 2017, (02):137-144.

[3] 张宁, 姜晶. 植物中小分子热激蛋白基因家族(sHSPs)研究进展[J]. 植物生理学报,2017,(06):943-948.

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4. 毕业设计(论文)计划

2022年11月-2022年12月,查阅相关文献,熟悉各种生物信息学数据库和软件;

2022年1月-2022年3月,完善技术路线,开展各种分析;

2022年4月-2022年5月,分析和整理实验结果,撰写论文。

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