基于二代测序技术开发乌苏里拟鲿性别特异分子标记任务书

 2023-02-25 11:02

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

利用2b-RAD简化基因组测序法对乌苏里拟鲿基因组DNA测序,筛选出雄性特异序列,然后对筛选出的雄性特异序列进行引物设计与验证,并对初步筛选出的雄性特异序列在验证群体中进一步验证,最后对性别特异序列进行同源比对。从而为乌苏里拟鲿性别决定机制研究及全雄育种提供有力工具。

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2. 实验内容和要求

1.内容

  • 利用苯酚-氯仿法提取乌苏里拟鲿基因组DNA
  • 采用2b-RAD测序技术筛选出性别特异DNA标记
  • 对筛选出SNP位点进行PCR引物设计与验证
  • 在NCBI中对性别特异标记序列进行BLASTn比对
  • 利用实验所得数据并搜集资料、阅读文献进行论文撰写

2.要求

  • 实验过程要谨遵实验室规章制度,操作规范
  • 阅读文献时多关注乌苏里拟鲿遗传性别鉴定、2b-RAD测序、性别特异分子标记、PCR等的资 料,并进行总结概括

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3. 参考文献

[1] DeanR, Mank J E. The role of sex chromosomes in sexual dimorphism: discordancebetween molecular and phenotypic data[J]. Journal of Evolutionary Biology,2014,27(7):1443-1453.

[2] WangX, Fu B, Yu X, et al. Fine mapping of growth-related quantitative trait loci inYellow River carp ( Cyprinus carpio haematoperus )[J]. Aquaculture,2018,484:277-285.

[3] ChristosP, Micha B, Q K M G, et al. A novel sex-determining QTL in Nile tilapia(Oreochromis niloticus).[J]. BMC genomics, 2015,16.

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4. 毕业设计(论文)计划

2022.9.16-2022.9.30 查阅文献

2022.10.9-2022.10.16 取乌苏里拟鲿基因组DNA

2022.10.21-2022.10.30 2b-RAD高通量测序与雄性特异性标记初筛

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