玉米TIFY基因家族的生物信息学分析任务书

 2023-10-09 10:10

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

1.掌握植物基因家族成员的鉴定、系统发育和表达分析方法。

2.鉴定出玉米基因组中的TIFY基因,明确其进化历史与机制及在不同组织器官中的表达模式。

2. 实验内容和要求

1.玉米TIFY基因的系统鉴定。通过BLAST比对和Pfam结构域验证,鉴定出玉米中TIFY家族所有成员;

2.基因复制事件和系统发育分析。通过分析TIFY家族的基因复制事件和系统发育关系,明确该家族的进化历史与机制;

3.基因表达模式分析。通过EST表达分析,明确玉米TIFY基因在不同组织器官中的表达模式。

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3. 参考文献

[1] 李肖琴. 苹果醛脱氢酶(ALDH)和TIFY基因家族的鉴定、系统进化及表达分析[D]. 西北农林科技大学, 2014

[2] 罗冬兰, 巴良杰, 陈建业, 等. 香蕉MaTIFY1转录因子特性及其在成熟过程中基因表达分析[J]. 园艺学报, 2017(01):43-52

[3] 安秀红, 厉恩茂, 李敏, 等. 苹果MdJAZ1基因表达及蛋白互作分析[J]. 中国农业科学, 2016(13):2642-2650.

4. 毕业设计(论文)计划

2022年11月-2022年12月,查阅相关文献,熟悉各种生物信息学数据库和软件;

2022年1月-2022年3月,完善技术路线,开展各种分析;

2022年1月-2022年5月,分析和整理实验结果,撰写论文。

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