比较转录组分析预测莲生物碱合成的关键基因任务书

 2021-09-01 09:09

1. 毕业设计(论文)主要内容:

莲是莲科(Nelumbonaceae)莲属(Nelumbo)的多年生水生草本植物,富含具有抗癌、抗氧化、抗病毒、减肥降脂、保肝护肝等功效的生物碱类。

研究表明,莲的主要生物碱组分均为苄基异奎宁类生物碱,莲心和荷叶两种器官合成完全不同的生物碱类。

莲心主要累积莲心碱等双苄基异奎宁类生物碱,而荷叶主要累积荷叶碱等阿朴啡类生物碱。

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2. 毕业设计(论文)主要任务及要求

1. 查阅不少于15篇的莲生物碱相关文献,其中英文文献不少于4篇,完成开题报告。

2. 对莲心和荷叶的转录组进行总体描述:数据量、表达的总基因数、总体GC含量等;

3. 比较莲心和荷叶两种器官的表达差异基因,并进行功能富集分析;

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3. 毕业设计(论文)完成任务的计划与安排

第1-2周:查阅文献,准备开题。

第3周:完成毕业论文开题报告,确定实验技术路线。

第4-14周:实验,结果分析,继续查阅文献,撰写论文,导师审阅,定稿。

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4. 主要参考文献

1. Ming R., VanBuren R., Liu Y., Yang M., Han Y., Li L., Zhang Q., Kim M., Schatz M.C. et al. 2013. Genome of the long-living sacred lotus (Nelumbo nucifera Gaertn.). Genome Biology 14: R41.

2. Mukherjee P.K., Mukherjee D., Maji A.K., Rai S., and Heinrich M. 2009. The sacred lotus (Nuleumbo nucifera) – phytochemical and therapeutic profile. Journal of Pharmacy and Pharmacology 61: 407–422.

3.张弦,潘扬。

植物莲中生物碱类成分的研究概况。

(2002)南京中医药大学学报,第18卷,第6期,382-384页。

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