mLST8基因和RPTOR基因的多态性位点与癌症相关性的荟萃分析任务书

 2021-11-14 09:11

1. 毕业设计(论文)主要内容:

mLST8基因和RPTOR基因是哺乳动物雷帕霉素靶蛋白复合物1(mTORC1)的组成基因,对mTOR基因起正调节功能。

近年来mTOR基因在正常发育和疾病的发生发展过程中的发挥着重要作用。

本研究拟以mLST8基因的rs26865和rs3160多态性位点,及RPTOR基因的rs3751932和rs3751934多态性位点为研究对象,对这四个多态性位点和癌症发生的相关性进行荟萃分析,为将来对mTORC1的深入研究提供线索和方向。

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2. 毕业设计(论文)主要任务及要求

  1. 查阅与本研究相关的中英文文献,完成开题报告;

  2. 在NCBI-SNP,SNPinfo等库中搜索查找rs26865和rs3160位点(mLST8基因),及rs3751932和rs3751934位点(RPTOR基因)的等位基因、不同人群中的频率分布和利用生物信息网站预测其可能存在的功能。

  3. 在文献数据库中对研究rs26865、rs3160、rs3751932和rs3751934位点与癌症相关性的文献进行检索,并下载全文。

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    3. 毕业设计(论文)完成任务的计划与安排

    第1周:调研阅读文献,准备开题;

    第2-4周:完成开题报告,熟悉和掌握本课题所涉及到的生物信息学网站的基本情况和使用方法;

    第5-13周:检索和下载mLST8基因(rs26865和rs3160位点)及RPTOR基因(rs3751932和rs3751934位点)与癌症发生相关性研究的文献。运用EndNote文献管理器管理文献,提取各研究中的rs26865、rs3160、rs3751932和rs3751934四个位点的基因分型数据,汇总后运用stata软件进行荟萃分析。

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    4. 主要参考文献

    1. He, J., Wang, M. Y., Qiu,L. X., Zhu, M. L., Shi, T. Y., Zhou, X. Y., . . . Wei, Q. Y. (2013). Geneticvariations of mTORC1 genes and risk of gastric cancer in an Eastern Chinesepopulation. Mol Carcinog, 52 Suppl 1, E70-79. doi:10.1002/mc.22013

    2. Shao, J., Li, Y., Zhao, P.,Yue, X., Jiang, J., Liang, X., He, X. (2014). Association of mTORpolymorphisms with cancer risk and clinical outcomes: a meta-analysis. PLoSOne, 9(5), e97085. doi:10.1371/journal.pone.0097085

    3. Xu, Y., Huang, Y., Weng,L., Zheng, J., Huang, Y., Lin, Y., . . . Chen, Y. (2019). Effects ofsingle-nucleotide polymorphisms in the mTORC1 pathway on the risk of brainmetastasis in patients with non-small cell lung cancer. J Cancer Res ClinOncol. doi:10.1007/s00432-019-03059-y

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