CD44基因rs187115多态性位点与癌症易感性的荟萃分析任务书

 2021-11-14 09:11

1. 毕业设计(论文)主要内容:

CD44基因位于人类11号染色体上,正常情况下转录翻译CD44蛋白参与体内淋巴细胞的循环及归巢行为,然而有研究学者发现异常表达的CD44基因有助于肿瘤的发生和转移。rs187115位点位于 CD44 基因的内含子上,该单核苷酸多态性位点可能与癌症的发生风险相关。前期研究显示CD44基因 rs187115 位点与肝癌、肺癌、宫颈癌的易感性显著相关,表明 rs187115位点可能影响个体癌症发生的遗传易感性。同时有研究结果显示CD44基因 rs187115位点与胃癌和结肠癌、直肠癌、乳腺癌的发生不相关,这些不一致的研究结果显示单个关联对照研究仍存在不足之处,如样本量小导致的统计力度不强等,因此本研究拟对CD44基因的rs187115位点和癌症易感性进行荟萃分析,为将来CD44基因与癌症发生风险的进一步研究提供线索和方向,有利于更有针对性的对特定癌症展开深入研究。

2. 毕业设计(论文)主要任务及要求

1.查阅与本研究相关的中英文文献,完成开题报告;

2.在NCBI,SNP info等数据库中搜索查找CD44基因的rs187115位点的碱基突变类型和不同种群中的分布频率和利用生物信息网站预测其可能存在的功能。

3.在数据库中对CD44基因的rs187115位点与癌症相关性研究的文献进行检索,并下载全文。

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3. 毕业设计(论文)完成任务的计划与安排

第1周:调研阅读文献,准备开题;

第2-4周:完成开题报告,熟悉和掌握本课题所涉及到的生物信息学网站的基本情况和使用方法;

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4. 主要参考文献

[1] F. Bray, J. Ferlay, I. Soerjomataram, R.L. Siegel, L.A. Torre, A.Jemal, Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortalityworldwide for 36 cancers in 185 countries, CA Cancer J Clin, 68 (2018) 394-424.

[2] W. Chen, R. Zheng, P.D. Baade, S. Zhang, H. Zeng, F. Bray, A. Jemal,X.Q. Yu, J. He, Cancer statistics in China, 2015, CA Cancer J Clin, 66 (2016)115-132.

[3] B.S. Shastry, SNPs: impact on gene function and phenotype, Methods MolBiol,578 (2009) 3-22.

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