中国马褂木HD-Zip的生物信息学分析任务书

 2022-02-25 09:02

1. 1. 毕业设计(论文)的内容、要求、设计方案、规划等

1.了解生物信息学的常用研究方法;

2.掌握常见基因家族分析方法,了解杂交鹅掌楸HD-ZipIII家族基因的功能,对其进行分析;

3.前言要求写出本领域研究进展,HDZipIII基因家族的功能及结构信息等。制定可执行研究方案:以马褂木全基因组序列信息为研究对象,通过注释结果及拟南芥中的蛋白序列,利用Pfam,Smart,Blast等软件进行家族成员鉴定;采集拟南芥本家族成员为参照,利用MEGA软件进行系统进化分析;通过Genescan等软件进行结构预测;利用MEME软件等进行基序分析。要求把分析数据做成柱状图、进化树、画出基因结构模式图、基序模式图,并加以深入分析。

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2. 参考文献(不低于12篇)

1.秦永芳,李登弟,李学宝. 植物 HD-Zip 转录因子研究进展[J]. 细胞生物学杂志. 2009, (31), 514-520 .

2.朱莹莹,于亮亮,汪杏芬. 李来庚. HD-Zip III 转录因子家族与植物细胞分化[J]. 植物学报 2013,48(2): 199-209.

3.王洁华,卢孟柱. 木本植物次生维管系统形态建成的基因调控与信号转导研究进展[J]. 林业科学,45, 127-134 (2009).

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