基于二代测序数据识别杨树SSR分子标记任务书

 2022-04-29 09:04

1. 毕业设计(论文)的内容、要求、设计方案、规划等

一、前言二代测序技术在生物科学各个领域里已得到了广泛的应用,高通量测序数据分析主要包括基因组序列拼接、SNP位点识别以及转录组分析等。

利用高通量测序数据识别群体里SSR分子标记,对构建林木整合的高密度遗传连锁图谱以及开展数量性状基因定位有着重要的意义。

二、方案拟定本研究利用小叶杨69杨杂交群体简化基因组测序数据以及亲本重测序数据,使用生物信息学分析软件,识别群体中SSR标记位点以及个体的基因型,为该杨树群体提供更多的遗传变异信息。

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2. 参考文献(不低于12篇)

[1]李文轲,李丰余,张思瑶等.基因组二代测序数据的自动化分析流程[J]. 遗传,2014, 38(8): 818-624.

[2]田斌,辛培尧,张雪娟等. 高通量测序技术在林木育种中的应用[J]. 林业科学,2013,12:130-134.

[3]王兴春,杨致荣,王敏等.高通量测序技术及其应用[J]. 中国生物工程杂志,2012,32(1): 109-114.

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