玉米半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因家族的生物信息学分析任务书

 2023-02-25 11:02

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

1. 掌握植物基因家族成员的鉴定、染色体分布和复制事件、系统发育、基因结构和保守基序、基因表达分析等方法。

2. 鉴定出玉米基因组中的CYS基因,明确其进化历史与机制、基因表达模式、蛋白质互作情况等。

2. 实验内容和要求

1.玉米中CYS基因的系统鉴定。通过关键词搜索、BLAST比对等手段鉴定出玉米中CYS家族所有成员;

2. 基因复制和系统发育分析。通过分析植物CYS基因的复制事件和系统发育关系,明确该家族的进化历史与机制;

3. 基因表达分析。通过检索NCBI EST数据库获得基因表达信息,明确玉米CYS基因在不同组织器官中的表达情况。

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3. 参考文献

[1] Manuel M, Zamira A, Pilar C, et al.. Comparative phylogenetic analysis of cystatin gene families from Arabidopsis, rice and barley [J]. Mol. Gen. Genomics, 2005, 273: 423–432.

[2] Kamel G, Jesus V, Pilar L, et al.. A constitutive cystatin-encoding gene from barley responds differentially to abiotic stimuli [J]. Plant Mol. Biol., 2001, 45: 599–608.

[3] 张洁琳, 付畅. 半胱氨酸蛋白酶及半胱氨酸蛋白酶抑制剂对逆境胁迫的应答[J]. 分子植物育种, 2018, 16(13): 4453-4459.

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4. 毕业设计(论文)计划

2022年11月-2019年12月,查阅相关文献,熟悉各种生物信息学数据库和软件;

2022年1月-2020年3月,完善技术路线,开展各种分析;

2022年4月-2020年5月,分析和整理实验结果,撰写论文。

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