HSF转录因子在模式植物水稻和拟南芥中的进化分析任务书

 2023-04-11 10:04

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

通过对水稻中HSF类转录因子的基因组学进化分析,以及其在其他三种模式植物拟南芥,段炳草,高粱中的综合分析,从而了解其保守结构域,分析其在HSF类基因家族在染色体上的复制情况,以及其在水稻不同物种中的表达情况,从而最终为这些基因在植物中的功能解析提供借鉴。

2. 实验内容和要求

内容是综合分析水稻以及其他四种模式植物中HSF类转录因子的进化等分子生物学和基因组学研究。热激转录因子(HSF)是植物热胁迫反应的主要调控元件。拟南芥基因组的测序,结果发现21个开放阅读框(ORF ),编码一类具有A-C家族的热激转录因子。在本研究中,我们通过生物信息学手段,来分析水稻,拟南芥中的HSF家族的特征,以及他们的亲缘关系。通过我们的研究,将为HSF未来的功能分析奠定基础。

要求:1:明确HSF类转录因子在水稻中的进化分析

2:HSF类转录因子在四种不同物种中的进化情况

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3. 参考文献

1. von Koskull-Doring P, Scharf KD, Nover L: The diversity of plant heat stress transcription factors. Trends Plant Sci 2007, 12(10):452-457.

2. Jin GH, Gho HJ, Jung KH: A systematic view of rice heat shock transcription factor family using phylogenomic analysis. J Plant Physiol 2013, 170(3):321-329.

3. Nover L, Bharti K, Doring P, Mishra SK, Ganguli A, Scharf KD: Arabidopsis and the heat stress transcription factor world: how many heat stress transcription factors do we need? Cell Stress Chaperones 2001, 6(3):177-189.

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4. 毕业设计(论文)计划

3月底以前完成HSF转录因子家族的生物信息学以及基因组学分析

4月1号-4月30号以前完成毕业论文的写作

5月份完成毕业论文答辩

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