全脑图像中的多尺度神经元结构区域检测任务书

 2021-11-09 21:58:10

1. 毕业设计(论文)主要内容:

1.进行全脑图像中前景和背景的检测,全脑图像背景中会有嘈杂的噪声点、高亮度点以及一些随机噪声。同时存在一些胶质细胞,会对神经元的标注和追踪工作产生干扰。

而我们的工作致力于实现神经元结构区域的识别和检测,将神经元细胞与其他胶质细胞区分开,从而加速神经元的标注工作与自动追踪工作。

2. 进行神经元枝条纠缠状态的检测,在全脑图像中,会有神经元枝条相邻的情况存在。我们希望对此进行区分,确定枝条状态。如相邻状态、交叉连接状态。

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2. 毕业设计(论文)主要任务及要求

1.查阅15篇相关文献(含近五年外文3篇),并每篇书写200—300字文献摘要(装订成册,带封面);

2.认真填写周记,完成800字开题报告;

3.完成5000中文字以上的相关英文专业文献翻译,并装订成册(中英文一起,带封面);

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3. 毕业设计(论文)完成任务的计划与安排

1. 2019/12/26—2020/1/12:查阅参考文献,明确选题;

2. 2020/1/13—2020/2/28:进一步阅读文献,并分析和总结;确定技术路线,完成并提交开题报告,翻译英文资料;

3. 2020/3/1—2020/4/5:熟悉所选用的开发平台进行需求分析,算法设计和实现等;

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4. 主要参考文献

1. Yan C, Li A, Zhang B, Ding W, Luo Q, et al. (2013) Automated and Accurate Detection of Soma Location and Surface Morphology in Large-Scale 3D Neuron Images. PLOS ONE 8(4): e62579. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0062579

2. Iqbal, A., Sheikh, A. Karayannis, T. DeNeRD: high-throughput detection of neurons for brain-wide analysis with deep learning. Sci Rep 9, 13828 (2019) doi:10.1038/s41598-019-50137-9

3. Bass, C., Helkkula, P., De, P. V., Clopath, C., and Bharath, A. A. (2017). Detection of axonal synapses in 3d two-photon images. PLoS ONE 12:e0183309. doi: 10.1371/journal.pone.0183309

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