植物转录组数据的生物信息学分析任务书

 2022-09-30 02:09

1. 毕业设计(论文)的内容、要求、设计方案、规划等

建立植物转录组数据的分析流程,包括:序列聚类拼接,基因注释 (功能注释,结构域预测等) 功能分类(GO,MIPS等),基因表达量分析文库基因总体分析(KEGG代谢途径) 和自动化分析平台构建

2. 参考文献(不低于12篇)

1植物基因在转录水平上的调控及其生物学意义张椿雨;龙艳;冯吉;孟金陵;遗传2植物转录因子的超表达及其在分子育种中的应用张秋平;杨宇红;谢丙炎;刘志敏; 分子植物育种 3植物转录因子的结构与调控作用刘强;张贵友;陈受宜;科学通报4烟草NAC转录因子NtNAC1的基因克隆与生物信息学分析田云;方俊;卢向阳;中国烟草学报5 一种新的基因注释语义相似度计算方法吴飞珍 ,马文丽 ,王旺迪,陈启龙,郑文岭生物信息学 第8卷第1期2 0 1 0 年3 月6 序列比对程序Blat在转录组数据分析中的应用杭兴宜 ,赵东升 ,张成岗《生物信息学》 2005年02期 7 基于unix的cDNA序列自动分析系统的构建和应用 符志彦;卢阳;叶兰汀;何智良;徐安龙;中山大学学报(自然科学版)8 生物信息学对计算机科学发展的机遇与挑战[J];何红波,谭晓超,李斌,李义兵; 生物信息学;2005年01期9 现代信息技术在生物信息学研究中的应用[J];朱海燕;情报探索;2006年08期10 基于信息论k-modes聚类法的基因表达数据分析刘文远.李建飞,王宝文,于家新《生物信息学》 2009年02期11 Sequence motif discovery with computational genome-wide analysisAkashi,H;Aoki,F;Toyota,M;Maruyama,R;Sasaki,Y;Mita,H;Tokura,H;Imai,K;Tatsumi,H;Tokino,T;Tumor Research. 2006, vol. 41, pp. 59-69 12Bioinformatics for characterization of genetic constitution in cancer patientsMiyata,S;Ushijima,M;Matsuura,M;Biotherapy. VOL.20;NO.3;PAGE.253-259(2006

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