白刺叶绿体基因组初步分析任务书

 2022-04-21 09:04

1. 毕业设计(论文)的内容、要求、设计方案、规划等

1、前言:要求认真阅读本领域参考文献,在前言中需对白刺从分类学、进化地位、生物学特性进行阐述,并对叶绿体基因组研究的意义进行分析,对基因组相关理论、技术、方法、研究进展进行总结。

2、方案制定:要求以已经拼装好的白刺叶绿体基因组为材料,通过生物信息学的方法进行基因注释、GC含量、密码子使用偏好、SNP位点等基础生物信息学分析,,对于其中一些关键基因进行深入分析,探讨沙漠植物的叶绿体基因组及关键基因的特点,并利用现有的叶绿体信息资源进行进化分析。

3、实验数据收集与处理:要求认真记录整个生物信息学分析中形成的数据,画出白刺的叶绿体基因组图谱,将注释出的基因列出表格,其他数据做成柱状图,饼状图,进化分析要求画出进化树。

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2. 参考文献(不低于12篇)

[1]邢少辰,CLARKE JIHONG LIU. 叶绿体基因组研究进展[J]. 生物化学与生物物理进展,2008,01:21-28.

[2]唐萍,王强,陈建群. 茄科植物叶绿体基因组插入、缺失和核苷酸替代的发生方式及影响[J]. 遗传,2008,11:1506-1512.

[3]李西文,胡志刚,林小涵,李卿,高欢欢,罗国安,陈士林. 基于454FLX高通量技术的厚朴叶绿体全基因组测序及应用研究[J]. 药学学报,2012,01:124-130.

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