水稻和拟南芥BRD结构域非典型激酶家族的生物信息学分析任务书

 2023-05-24 10:05

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

1.掌握植物基因家族成员的鉴定、系统发育和表达分析方法。

2.鉴定出水稻和拟南芥基因组中的布罗莫结构域基因,明确其进化历史与机制,及在不同组织器官中的表达情况。

2. 实验内容和要求

1. 水稻和拟南芥BRD基因的系统鉴定。通过关键词搜索、BLAST比对等手段鉴定出水稻和拟南芥BRD家族所有成员;

2. 基因复制事件和系统发育分析。通过分析OsBRD 和AtBRD家族的基因复制事件和系统发育关系,明确该家族的进化历史与机制;

3. 基因表达模式分析。通过EST和芯片数据分析,明确OsBRD和AtBRD基因在不同组织器官中的表达模式。

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3. 参考文献

[1] Jones M, Hamana N, Nezu J. A novol family of brodomain genes [J]. Genomics, 2000, 63: 40-45.

[2] Hone P, Peterson C.The bromodain: a novel of ATP-dependent chromatin remodening ? [J]. Frontier in Bioscience, 2001, 6: 1019-1023.

4. 毕业设计(论文)计划

2022年11月-2022年12月,查阅相关文献,熟悉各种生物信息学数据库和软件;

2022年1月-2022年3月,完善技术路线,开展各种分析;

2022年4月-2022年5月,分析和整理实验结果,撰写论文。

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