玉米PIKK非典型蛋白质激酶家族的生物信息学分析任务书

 2023-05-24 10:05

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

1. 掌握植物基因家族成员的鉴定、基因结构和表达分析方法。

2. 鉴定出玉米基因组中的PIKK基因,明确其基因结构与染色体分布,及在不同组织器官中的表达情况。

2. 实验内容和要求

1. 玉米 PIKK基因的系统鉴定。通过关键词搜索、BLAST比对等手段鉴定出玉米PIKK家族所有成员;

2. 基因结构和染色体分布分析。通过将cDNA序列和基因组序列比较,明确该家族的基因结构;

3. 基因表达模式分析。通过EST和RNAseq数据分析,明确玉米PIKK基因在不同组织器官中的表达模式。

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3. 参考文献

[1] Lempiainen H, Halazonetis T. Emerging common themes in regulation of PIKKs and PI3Ks [J]. EMBO J., 2009, 28: 3067-3073.

[2] Abraham R. PI 3-kinase related kinases: big players in stress-induced signaling pathways [J]. DNA repair, 2004: 883-887.

[3] 张辉, 胡逢恺. 抑制mTOR的抗肿瘤药物的研究进展[J]. 2007, 9(3): 66-70.

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4. 毕业设计(论文)计划

2022年11月-2022年12月,查阅相关文献,熟悉各种生物信息学数据库和软件;

2022年1月-2022年3月,完善技术路线,开展各种分析;

2022年4月-2022年5月,分析和整理实验结果,撰写论文

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