水稻PIKK非典型蛋白质激酶家族的生物信息学分析任务书

 2023-05-24 10:09:02

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

1.掌握植物基因家族成员的鉴定、基因结构和表达分析方法。

2.鉴定出水稻基因组中的PIKK基因,明确其基因结构与染色体分布,及在不同组织器官中的表达情况。

2. 实验内容和要求

1.水稻PIKK基因的系统鉴定。通过关键词搜索、BLAST比对等手段鉴定出水稻PIKK家族所有成员;

2.基因结构和染色体分布分析。通过将cDNA序列与基因组序列比较,明确该家族基因的基因结构;

3.基因表达模式分析。通过EST和芯片数据分析,明确水稻PIKK基因在不同组织器官中的表达模式。

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3. 参考文献

[1]OkkenhaugK,BilancioA,FarjotG,etal.ImpairedBandTcellantigenreceptorsignalinginp110δPI3-kinasemutantmice.Science,2002,297:10311034.

[2]钮旭光,陈其军,刘强东,等.磷酸肌醇依赖性蛋白激酶-1激活AGC家族激酶的机制研究进展.农业生物技术学报,2005,6:2-3.

[3]RuellandE,CantrelC,GawerM,etal.ActivationofphospholipasesCandDisanearlyresponsetoacoldexposureinArabidopsissuspensioncells.PlantPhysiol.,2000,130:9991007.

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4. 毕业设计(论文)计划

2014年11月-2014年12月,查阅相关文献,熟悉各种生物信息学数据库和软件;

2015年1月-2015年3月,完善技术路线,开展各种分析;

2015年4月-2015年5月,分析和整理实验结果,撰写论文。

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