拟南芥PEX11基因家族的鉴定和表达分析任务书

 2023-10-09 10:10

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

1. 掌握植物基因家族成员的鉴定、系统发育和表达分析方法。

2. 鉴定出拟南芥基因组中的PEX11基因,明确其进化历史与机制及在不同组织器官中的表达模式。

2. 实验内容和要求

1. 拟南芥PEX11基因的鉴定。通过BLAST比对搜索结合Pfam验证,鉴定出拟南芥PEX11基因家族所有成员;

2. 基因复制事件和系统发育分析。通过分析拟南芥PEX11基因家族的系统发育关系和基因复制事件,明确该家族的进化历史与机制;

3. 基因表达模式分析。通过EST数据表达分析,明确拟南芥PEX11基因在不同组织器官中的表达模式。

3. 参考文献

[1] Nayidu N, Wang L, Xie W. Comprehensive sequence and expression profile analysis of PEX11 gene family in rice. Gene, 2008, 412(1-2): 5970

[2] 杨晶,安洋,徐欣欣等. 灰黄青酶Pa-pex11基因对青霉素产生的影响. 微生物学报, 2009, 49(11): 1477-1482

[3] 马兰,薛韶娜,冯胜泽等. 玉米大斑病菌StPEX11基因家族的鉴定及生物信息学分析.玉米科学, 2016, 249(6): 36-40

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4. 毕业设计(论文)计划

2022年11月-2022年12月,查阅相关文献,熟悉各种生物信息学数据库和软件;

2022年1月-2022年3月,完善技术路线,开展各种分析;

2022年4月-2022年5月,分析和整理实验结果,撰写论文。
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